سیبٹکیلو، آوش، ایتھوپیا میں جینوم کی وسیع آبادی کی جینیات اور انوفلیس مچھروں میں کیڑے مار دوا کے خلاف مزاحمت کی سالماتی نگرانی

2012 میں جبوتی میں اس کی دریافت کے بعد سے، ایشیائی اینوفلیس سٹیفنسی مچھر پورے ہارن آف افریقہ میں پھیل چکا ہے۔ یہ حملہ آور ویکٹر پورے براعظم میں پھیل رہا ہے، جو ملیریا پر قابو پانے کے پروگراموں کے لیے ایک سنگین خطرہ ہے۔ ویکٹر کنٹرول کے طریقوں، بشمول کیڑے مار دوا سے علاج شدہ بیڈ نیٹ اور اندرونی بقایا چھڑکاو نے ملیریا کے بوجھ کو نمایاں طور پر کم کیا ہے۔ تاہم، کیڑے مار دوا سے مزاحم مچھروں کا بڑھتا ہوا پھیلاؤ، بشمول اینوفیلس سٹیفنسی آبادی، ملیریا کے خاتمے کی جاری کوششوں میں رکاوٹ بن رہی ہے۔ ملیریا پر قابو پانے کی موثر حکمت عملیوں کی رہنمائی کے لیے آبادی کے ڈھانچے کو سمجھنا، آبادیوں کے درمیان جین کے بہاؤ، اور کیڑے مار دوا کے خلاف مزاحمت کے تغیرات کی تقسیم ضروری ہے۔
ہماری سمجھ کو بہتر بنانا کہ کس طرح An. سٹیفنسی HOA میں اتنا قائم ہو گیا ہے کہ نئے علاقوں میں اس کے ممکنہ پھیلاؤ کی پیشن گوئی کرنے کے لیے اہم ہے۔ آبادی کی ساخت، جاری انتخاب، اور جین کے بہاؤ 18,19 میں بصیرت حاصل کرنے کے لیے ویکٹر پرجاتیوں کا مطالعہ کرنے کے لیے پاپولیشن جینیٹکس کا بڑے پیمانے پر استعمال کیا گیا ہے۔ این کے لیے۔ سٹیفنسی کے مطابق، آبادی کی ساخت اور جینوم کی ساخت کا مطالعہ اس کے حملے کے راستے اور اس کے ظہور کے بعد سے رونما ہونے والے کسی بھی انکولی ارتقاء کو واضح کرنے میں مدد کر سکتا ہے۔ جین کے بہاؤ کے علاوہ، انتخاب خاص طور پر اہم ہے کیونکہ یہ کیڑے مار دوا کے خلاف مزاحمت سے وابستہ ایللیس کی شناخت کر سکتا ہے اور اس پر روشنی ڈال سکتا ہے کہ یہ ایللیس کس طرح آبادی میں پھیل رہے ہیں۔
آج تک، حملہ آور پرجاتیوں Anopheles Stephensi میں کیڑے مار ادویات کے خلاف مزاحمت کے نشانات اور آبادی کے جینیات کی جانچ چند امیدوار جینوں تک محدود رہی ہے۔ افریقہ میں پرجاتیوں کا ظہور مکمل طور پر نہیں سمجھا جاتا ہے، لیکن ایک مفروضہ یہ ہے کہ اسے انسانوں یا مویشیوں نے متعارف کرایا تھا۔ دیگر نظریات میں ہوا کے ذریعے لمبی دوری کی منتقلی شامل ہے۔ اس مطالعے میں استعمال ہونے والے ایتھوپیا کے الگ تھلگوں کو عدیس ابابا سے 200 کلومیٹر مشرق میں واقع ایک قصبہ آوش سبات کلو میں اور ادیس ابابا سے جبوتی تک مرکزی ٹرانسپورٹ کوریڈور پر جمع کیا گیا تھا۔ آوش سبات کلو ایک ایسا علاقہ ہے جس میں ملیریا کی زیادہ منتقلی ہوتی ہے اور اس میں انوفیلس اسٹیفینسی کی ایک بڑی آبادی ہے، جس کے بارے میں اطلاع ہے کہ وہ کیڑے مار ادویات کے خلاف مزاحم ہے، جو اسے اینوفیلس اسٹیفینسی8 کی آبادی کے جینیات کے مطالعہ کے لیے ایک اہم مقام بناتا ہے۔
ایتھوپیا کی آبادی میں کم تعدد پر کیڑے مار مزاحمتی تغیرات kdr L1014F کا پتہ چلا اور ہندوستانی کھیت کے نمونوں میں اس کا پتہ نہیں چلا۔ یہ kdr اتپریورتن pyrethroids اور DDT کے خلاف مزاحمت فراہم کرتا ہے اور اس کا پتہ پہلے An میں پایا گیا تھا۔ 2016 میں ہندوستان میں اور افغانستان میں 2018.31,32 میں سٹیفنسی کی آبادی جمع کی گئی دونوں شہروں میں پائیرتھرایڈ مزاحمت کے وسیع ثبوت کے باوجود، یہاں تجزیہ کی گئی منگلور اور بنگلور کی آبادیوں میں kdr L1014F اتپریورتن کا پتہ نہیں چلا۔ اس SNP کو لے جانے والے ایتھوپیا کے الگ تھلگ افراد کا کم تناسب جو کہ متضاد تھے اس سے پتہ چلتا ہے کہ حال ہی میں اس آبادی میں تغیر پیدا ہوا۔ اس کی تائید آواش میں کی گئی ایک سابقہ ​​تحقیق سے ہوتی ہے جس میں یہاں تجزیہ کیے جانے والے سال سے پہلے جمع کیے گئے نمونوں میں کے ڈی آر اتپریورتن کا کوئی ثبوت نہیں ملا۔ 18 ہم نے پہلے اسی علاقے/سال کے نمونوں کے ایک سیٹ میں کم تعدد پر اس kdr L1014F اتپریورتن کی نشاندہی ایک ایمپلیکن ڈیٹیکشن اپروچ کا استعمال کرتے ہوئے کی تھی۔ ریزسٹنس مارکر تجویز کرتا ہے کہ ٹارگٹ سائٹ میں ترمیم کے علاوہ دیگر میکانزم اس مشاہدہ شدہ فینوٹائپ کے لیے ذمہ دار ہیں۔
اس مطالعے کی ایک حد کیڑے مار دوا کے ردعمل پر فینوٹائپک ڈیٹا کی کمی ہے۔ مکمل جینوم سیکوینسنگ (WGS) یا ٹارگٹڈ ایمپلی کون سیکوینسنگ کو حساسیت کے بائیوسیز کے ساتھ ملا کر مزید مطالعات کی ضرورت ہے تاکہ کیڑے مار دوا کے ردعمل پر ان تغیرات کے اثرات کی چھان بین کی جا سکے۔ یہ ناول غلط SNPs جو مزاحمت کے ساتھ وابستہ ہوسکتے ہیں ان کو نگرانی کی حمایت کرنے اور مزاحمتی فینوٹائپس سے وابستہ ممکنہ میکانزم کو سمجھنے اور ان کی توثیق کرنے کے لئے فنکشنل کام کی سہولت فراہم کرنے کے لئے ہائی تھرو پٹ مالیکیولر اسسیس کے لئے نشانہ بنایا جانا چاہئے۔
خلاصہ طور پر، یہ مطالعہ تمام براعظموں میں اینوفلیس مچھروں کی آبادی کے جینیات کی گہری تفہیم فراہم کرتا ہے۔ مختلف جغرافیائی خطوں میں نمونوں کے بڑے گروہوں پر پورے جینوم کی ترتیب (WGS) کے تجزیے کا اطلاق جین کے بہاؤ کو سمجھنے اور کیڑے مار ادویات کے خلاف مزاحمت کے نشانات کی شناخت کے لیے کلیدی حیثیت رکھتا ہے۔ یہ علم صحت عامہ کے حکام کو ویکٹر کی نگرانی اور کیڑے مار دوا کے استعمال میں باخبر انتخاب کرنے کے قابل بنائے گا۔
ہم نے اس ڈیٹاسیٹ میں کاپی نمبر کی تبدیلی کا پتہ لگانے کے لیے دو طریقے استعمال کیے ہیں۔ سب سے پہلے، ہم نے کوریج پر مبنی نقطہ نظر کا استعمال کیا جس نے جینوم میں شناخت شدہ CYP جین کلسٹرز پر توجہ مرکوز کی (ضمنی جدول S5)۔ نمونے کی کوریج کو جمع کرنے والے مقامات پر اوسطاً چار گروپوں میں تقسیم کیا گیا: ایتھوپیا، ہندوستانی فیلڈ، ہندوستانی کالونیاں، اور پاکستانی کالونیاں۔ ہر گروپ کے لیے کوریج کو دانا کی ہمواری کا استعمال کرتے ہوئے معمول بنایا گیا تھا اور پھر اس گروپ کے لیے میڈین جینوم کوریج کی گہرائی کے مطابق منصوبہ بنایا گیا تھا۔